Нет стандартных библиотек таких как datetime, logging… под windows
Что значит “нет стандартных библиотек”? Вы какою дистрибутив Python или Jython устанавливали?
Jython, может не так переменную среды объявил, JYTHONPATH?
Можно более конкретно описать проблему?
Jython где стоит, скажем, какие библиотеки есть в его папках (если есть), какой именно библиотеки он не видит?
Или исправилось уже?
почистил реестр и ок